中央研究院的预算日前遭到立法院冻结，李远哲院长表示，如果这种科技预算遭到删除之事一再出现，到最后国内的科技发展，很可能连日本、韩国都赶不上，因此他主张仿效国外做法，把所有的民间科技团体结合起来，成立一个强大的民间科技社群，在科技经费遭到删除时得以据理力争，一起为国家未来的科技发展来努力。

李远哲本周一(15日)参加第六届全国科学技术会议，在「国家科技发展总目标、策略与资源规划」的议题上对于国内的科技预算遭到删除或冻结的情况发表看法。此外，李远哲表示，国家科技发展必需要拟定出重点方向，然后全力发展，全国科学技术会议的召开，就是应该要订出国家科技发展的大政方针。他认为未来有三个重要的科技领域是值得投入发展的，包括信息科技、生物科技、燃料电池等，国内相关人士应共同讨论，形成发展共识与策略，而不能漫无目的的各行其事，那是无法将台湾带到世界的前端。