智慧醫療這幾年的布局速度加快，目前各IT廠商與醫療機構紛紛投入發展，目前台灣醫療機構的IT系統已相當普及，雖然政府一直在推動醫療分級，不過中小型醫院還是會有本身的利益考量，認為轉診將會失去病患，再加上各個醫療院所的IT系統未整合，這都讓台灣的智慧醫療發展面臨困難。

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台灣的企業e化推動時間早，包括醫療產業在內的各垂直領域，都有一定的IT系統，尤其醫療領域的數位化已啟動超過10年以上，數據資料都已有一定程度的數位化，不過由於台灣的醫療發達，大中小型的醫療院所數量多，投入開發系統的IT廠商也多，過去由於各診所醫院的作業各自為政，自己的系統只需服務本身醫療流程，資料不需與其他醫院介接，然而在政府開始啟動智慧醫療政策下，醫療體系中各環節的資料必須互連互用，醫療IT系統的效益才能有效發揮，因此台灣要落實智慧醫療願景，就必須解決此一問題。

要讓兩套不同的系統鏈結容易，但是若是系統數量放大到十數種乃至於數十種，其難度就不僅是倍增，不同系統的數據格式、平台介面，都必須重新理解才能撰寫程式，此外各醫療院所的系統建置先後不同，部分醫療院所的IT廠商甚至早已不知去向，對IT廠商來說，都是難以解決的問題。

除了技術上的問題，還有營運上的考量，就曾有醫療IT系統廠商坦言，對中小型醫院來說，轉診往往等於失去一個病患的收入，雖然在醫德考量下，台灣的醫師都會顧及病情建議轉院，而且會將病歷同時轉移，然而轉診過程中，在中小醫療院部分所做的檢驗資料未必能夠跟隨病患，許多檢驗必須重複再做，這不但會造成醫療成本的浪費，也會拖延到醫療時間。

醫療體系的系統若未整合，將延遲智慧醫療的佈建腳步，從而拖慢政策的落實，醫療分級就會是其一，在資源最佳化的考量下，小病看小診所、大病看大醫院，將可讓醫療資源被有效利用，因此台灣必須加快不同院所的系統整合速度，這也是智慧醫療政策最重要的一步。