根据Vista测试用户表示，最终版本的Vista与Windows Live Messenger不兼容，每天最高可冲突20次，此外，Microsoft自己所推出的数字音乐播放器Zune，也无法兼容Vista操作系统。

先前Microsoft测试报告便指出Vista测试版与Windows Live Messenger 8.0正式版和8.1测试版之间相互冲突，以为此问题可以在Vista正式版中获得解决。不过依据多名Vista正式版测试用户的回馈意见中显示，此类问题仍未得到完满解决。测试者有的表示，Windows Live Messenger在Vista上运作3个小时之后，就开始不断冲突，有时连续冲突4次。有的测试者表示，尽管Windows Live Messenger 8.0比8.1稳定，但还是与Vista不兼容，就好像新版播放器WMP 11一般。且Windows Live Messenger 8.0每天可能只冲突1次，但8.1每天可以冲突到10-20次。相比之下，AIM 6.0测试版在Vista上运作平顺。

Microsoft并不否认Windows Live Messenger 8.1与Vista的问题仍有改善进步的空间，并且表示该问题将在8.1正式版中完全解决。

至于Vista与Zune播放器之间的冲突问题，Microsoft比较轻松地认为，用户只需等待往后的更新程序即可。不过Microsoft的发言人已经表示，支持Vista操作系统的全新Zune播放器，因此将无法在明年2007年1月底之前上市，这意味着Zune将无法搭上Vista消费者版本操作系统的顺风车热销狂卖。

甚者，目前Zune并不能兼容Microsoft旗下的MSN音乐商店。