智慧医疗这几年的布局速度加快，目前各IT厂商与医疗机构纷纷投入发展，目前台湾医疗机构的IT系统已相当普及，虽然政府一直在推动医疗分级，不过中小型医院还是会有本身的利益考量，认为转诊将会失去病患，再加上各个医疗院所的IT系统未整合，这都让台湾的智慧医疗发展面临困难。

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台湾的企业e化推动时间早，包括医疗产业在内的各垂直领域，都有一定的IT系统，尤其医疗领域的数位化已启动超过10年以上，数据资料都已有一定程度的数位化，不过由於台湾的医疗发达，大中小型的医疗院所数量多，投入开发系统的IT厂商也多，过去由於各诊所医院的作业各自为政，自己的系统只需服务本身医疗流程，资料不需与其他医院介接，然而在政府开始启动智慧医疗政策下，医疗体系中各环节的资料必须互连互用，医疗IT系统的效益才能有效发挥，因此台湾要落实智慧医疗愿景，就必须解决此一问题。

要让两套不同的系统链结容易，但是若是系统数量放大到十数种乃至於数十种，其难度就不仅是倍增，不同系统的数据格式、平台介面，都必须重新理解才能撰写程式，此外各医疗院所的系统建置先後不同，部分医疗院所的IT厂商甚至早已不知去向，对IT厂商来说，都是难以解决的问题。

除了技术上的问题，还有营运上的考量，就曾有医疗IT系统厂商坦言，对中小型医院来说，转诊往往等於失去一个病患的收入，虽然在医德考量下，台湾的医师都会顾及病情建议转院，而且会将病历同时转移，然而转诊过程中，在中小医疗院部分所做的检验资料未必能够跟随病患，许多检验必须重复再做，这不但会造成医疗成本的浪费，也会拖延到医疗时间。

医疗体系的系统若未整合，将延迟智慧医疗的布建脚步，从而拖慢政策的落实，医疗分级就会是其一，在资源最隹化的考量下，小病看小诊所、大病看大医院，将可让医疗资源被有效利用，因此台湾必须加快不同院所的系统整合速度，这也是智慧医疗政策最重要的一步。