自「台湾地区特定高科技人员进入大陆地区任职许可办法草案」出现后，科技业者不满政府订定的政策，管制高科技人才赴大陆就职，因此扬言将控告政府违宪。行政院表示，该项政策仍在内部审查阶段，内容若有不妥之处，将请陆委会、国科会再做局部调整。

自今年行政院公布八吋晶圆厂登陆政策后，国科会于今年4月提出高科技人才赴大陆任职的许可办法。据了解，该管制人才赴大陆任职法进入行政院后，并未按照一般法规程序，​​由政务委员召开政务审查会，邀跨部会代表会商，而仅是行政院内部幕僚进行一般审查。据媒体报导某官员表示，行政院仅是核备性质，若审查后无逾越母法，该政策将予以过关，无需比照一般法规进行政务审查等程序。

高科技人才赴大陆任职的许可办法方面，由于外界反弹声浪不断，国科会于今年5月送出的草案，仅规范首波管制范围为晶圆厂黄光区微影技术之研发人员，而先前所列包括半导体产品研发设计人才等四项产业及技术类别都暂不列入。