根據CNET網站報導，即時傳訊(Instant Messenging)和P2P軟體帶給企業的困擾，可能不只是浪費時間、降低生產力問題而已，還可能造成安全上的隱憂。

安全公司指出，像Yahoo!Messenger、MSN Messenger或是P2P檔案交換軟體，可能因為員工外洩機密資訊，或是引進惡意程式，而對企業資訊安全產生威脅。P2P軟體及IM軟體近來因為檔案交換服務及VoIP等應用十分受歡迎，但檔案交換服務可以找到形形色色的個人機密資訊，而企業員工若不當使用P2P軟體，可能造成更大危險。

安全軟體公司Websense技術顧問林皇興表示，國內許多企業員工安裝P2P或是IM軟體，除了可能讓員工利用上班時間聊天而降低生產力外，也可能成為惡意程式或病毒入侵企業網路的入口。他指出，許多利用P2P軟體進行交換的軟體，可能遭到改版、加入木馬程式，而一經執行，就會導致員工電腦感染病毒或被植入後門。

趨勢科技表示，其實P2P軟體或IM軟體，就像電子郵件一般，只是病毒傳染的途徑之一。重要的是管理以及培養員工正確使用觀念。防毒軟體供應商包括趨勢科技或賽門鐵克等，都將P2P及IM軟體納入掃瞄的範圍中，在使用者完成檔案交換並存檔後，開始掃瞄有無符合病毒特徵的程式碼。