外交部领事事务局已紧锣密鼓规画「芯片护照」，把台湾民众的脸部生物特征及基本数据，植入护照封底一小块芯片内，预计今年底前，开始小量发行，此外，台湾民众出入国境之时，除了要向查验员出示持有的护照之外，还要对着生物辨识的摄影镜头来个「脸部特写」，好让辨识信息传入计算机系统比对，确认护照持有人的身分真伪。

外交部领事事务局早已规画在年底发行「芯片护照」，将把本国人的脸部生物特征及基本数据，植入护照芯片内。外交部发言人王建业指出，芯片护照是因应世界潮流，但还无确切时间，目前规划芯片内容不超出现有护照的数据范围。做此规划主要是因应世界潮流，与国际民航组织规范接轨，目前规划的芯片内容仅将现有护照的基本数据数字化，在生物特征的部分仅含有现有的相片，并不包含指纹、虹膜等。据统计每年持护照通关的国人有近500万人，目前已有35个国家使用芯片护照，从未来世界潮流走向一致化的趋势来看，使用芯片护照会更便利和单纯化；此外，芯片护照的防伪及安全性都会比旧式护照还好。

从外观来看，具备生物特征辨识功能的电子护照和传统护照没什么两样，只是护照最后一页嵌入芯片，芯片内除了储存护照上各项基本数据，例如：护照本人的电子档，还存有其各项生物特征数据，包括：脸部特征，未来还可能包括：护照本人的指纹及虹膜等。

除了具备防伪功能，新护照还用到「无线射频辨识技术」（RFID），这就像搭捷运时使用悠游卡，利用电磁感应方式读取数据，有助于旅客快速通关，这项系统类似传统护照上的条形码或磁条，但最大不同是能够长距离读取，一次读取数百笔数据，可节省大量时间。外交部透露，为了便于本国旅客快速通关，移民署也在发展「自动通关系统」，第一道匣门先确认护照是否为本人，第二道匣门再确认是否遭限制出入境，不过，台湾当局规范相关护照芯片的使用方式，尚未完成立法程序，外交部已提出《护照条例修正草案》并交付立院审查，为国人生物特征植入护照芯片，取得法源依据。

虽然国际民航组织声称2010年要世界各国采用电子护照，目前已有欧美、亚太等30多个国家使用新型电子护照，但人权学者廖元豪指出，其余的79个国家，完全不印发那种带有条形码或磁条的护照，电子护照更不可能使用，因为这些国家根本不具备这种科技。国际民航组织声称要全球各国采用，恐怕是个遥不可及的梦想。