外交部領事事務局已緊鑼密鼓規畫「晶片護照」，把台灣民眾的臉部生物特徵及基本資料，植入護照封底一小塊晶片內，預計今年底前，開始小量發行，此外，台灣民眾出入國境之時，除了要向查驗員出示持有的護照之外，還要對著生物辨識的攝影鏡頭來個「臉部特寫」，好讓辨識資訊傳入電腦系統比對，確認護照持有人的身分真偽。

外交部領事事務局早已規畫在年底發行「晶片護照」，將把本國人的臉部生物特徵及基本資料，植入護照晶片內。外交部發言人王建業指出，晶片護照是因應世界潮流，但還無確切時間，目前規劃晶片內容不超出現有護照的資料範圍。做此規劃主要是因應世界潮流，與國際民航組織規範接軌，目前規劃的晶片內容僅將現有護照的基本資料數位化，在生物特徵的部分僅含有現有的相片，並不包含指紋、虹膜等。據統計每年持護照通關的國人有近500萬人，目前已有35個國家使用晶片護照，從未來世界潮流走向一致化的趨勢來看，使用晶片護照會更便利和單純化；此外，晶片護照的防偽及安全性都會比舊式護照還好。

從外觀來看，具備生物特徵辨識功能的電子護照和傳統護照沒什麼兩樣，只是護照最後一頁嵌入晶片，晶片內除了儲存護照上各項基本資料，例如：護照本人的電子檔，還存有其各項生物特徵資料，包括：臉部特徵，未來還可能包括：護照本人的指紋及虹膜等。

除了具備防偽功能，新護照還用到「無線射頻辨識技術」（RFID），這就像搭捷運時使用悠遊卡，利用電磁感應方式讀取資料，有助於旅客快速通關，這項系統類似傳統護照上的條碼或磁條，但最大不同是能夠長距離讀取，一次讀取數百筆資料，可節省大量時間。外交部透露，為了便於本國旅客快速通關，移民署也在發展「自動通關系統」，第一道匣門先確認護照是否為本人，第二道匣門再確認是否遭限制出入境，不過，台灣當局規範相關護照晶片的使用方式，尚未完成立法程序，外交部已提出《護照條例修正草案》並交付立院審查，為國人生物特徵植入護照晶片，取得法源依據。

雖然國際民航組織聲稱2010年要世界各國採用電子護照，目前已有歐美、亞太等30多個國家使用新型電子護照，但人權學者廖元豪指出，其餘的79個國家，完全不印發那種帶有條碼或磁條的護照，電子護照更不可能使用，因為這些國家根本不具備這種科技。國際民航組織聲稱要全球各國採用，恐怕是個遙不可及的夢想。