昨日（3/4）南台灣一陣天搖地動，震央源自高雄縣甲仙鄉，連帶引起面板、晶圓廠產能吃緊的危機。南科管理局局長陳俊偉表示，這是南科成立以來遭遇強度最高的地震。即使如921，南科所遭遇的衝擊也僅止於4級；但3月4日所遭遇的震動級數為5級。

過去，南科廠商遇到地震，多能在一天內恢復生產線運行，但昨日南部不但發生兩起較大地震，餘震也頻仍，所受影響多超過預期水準。台積電公告本次對晶圓流程損失約1.5天，奇美電面板產能更是史無前例地波及2天。設備商預估，台積電可能因此損失約4億元產值，由於台積電和聯電在南科都設有12吋晶圓廠，短期內，12吋晶圓的供貨缺口將更加擴大；而面板產業，雖恐影響3、4月的出貨量與業績，但因此段時間正好也是淡季，影響不若晶圓代工嚴重。

事實上，南科在開發初期，就曾因為位處高鐵行經之處，無法達到對廠商「兩百公尺處振動減為四十八分貝」的許諾，而爆發「振動」疑慮，當時，南下投資的晶圓大廠許多選擇撤資，如當時，華邦電0.11微米、12吋晶圓製程設廠，在多方考量之下，決定放棄南科，在當時的科技界引起一陣譁然，而介入調停的除了轄管科學園區的國科會外，在地父母官台南縣政府，也歷經了兩任縣長的不斷奔走。

後來，南科所採行的方式是進行一連串的減振工程，並於較靠近高鐵軌道的區域，引進公共造景工程及較不受振動干擾的產業如生物技術，無心插柳之下，也意外造就南科逐漸成形的生技廊帶。南科管理局高層人員就曾打趣的說，生物技術常常需要把培養皿「shake」一下，設在高鐵旁邊剛剛好。

甲仙地震對南科的影響還需要一段時間觀察，也是考驗廠商危機處理的一個關卡；不過，天公似乎較常給予危機考驗。從建廠初期的淹水窘狀，直至後來的高鐵振動事件，現在甲仙大地震，震得晶圓代工業神經緊繃，南科還真是台灣科技園區中的「歹命寶寶」。