经济部商业司「网际网路商业应用计画」的执行单位资策会，由7月1日至12月31日之间，进行「B2B EC总体衡量指标调查」，结果显示有将近一半的企业已进行企业间电子商务，而网路交易安全疑虑则为企业导入B2B EC的最大障碍，而多数中型企业在成本效益考量下，决定不导入B2B EC的状况下，将会影响到大型企业的导入成效。

此次调查研究对象是针对6大产业，包括综合零售、药妆业、3C流通业、图书业、旅游业、成衣服饰业，有效样本共432份。根据调查显示，目前已经有将近一半企业已使用专属网路或Internet进行企业间电子商务，其中商品型录、接单、订单追踪为现阶段B2B EC主要应用领域，目前电子邮件仍为企业与上下游之间的主要传递方式，不过仍有32％的企业，不愿导入EC应用。

以99年企业B2B交易金额占整体营运比重与2000年相较，企业透过专线或Internet向上下游接单的比例都呈倍数成长，而事实上B2B EC对企业效率及成本也有颇大的帮助，包括降低人事成本、降低生产成本、缩点交货期限、降低客服成本，但以业务联系与采购成本成效最为显著。

而台湾企业导入B2B EC营运面瓶颈，则有经营阶层认知不足、缺乏资讯人才、资讯化程度不足、原有营运模式不适用网路交易，不过上下游配合意愿则是营运面的关键因素，而多数中型企业在成本考量下不导入电子商务，将会影响到大型企业导入成效。