一项由南亚科技等科学园区外厂商所推动，修改现行「促建产业升级条例」，促使政府给予园区内外重要策略性产业同等租税条件的提案，已由立法院委员联署完成并已付委；此案通过与否对于南亚科技与外商Infineon的合作，将有决定成败的关键性影响。

现行促产条例中明定，科学园区内厂商可免关税、营业税，但园区外厂商却无法获得同等优惠，而「促进产业升级条例九条之二」条例草案的立法目的，即是为弭平租税差异，增加高科技厂商的投资意愿；草案中订定，园区外科学工业的公司，自国外输入自用的机器、设备、原料、物料，免征进口税及营业税，亦订出了五年内不得转移使用权的期限，但移转给科学园区、加工出口区及其他科学工业公司则不在此限。

此项立法草案的幕后推手南亚科技，目前正进行与欧洲第一大半导体制造厂英飞凌（Infineon）采共同开发新制程技术的合作案，已于五月初签订备忘录，但却传出科学园区内外租税条件不一致，可能影响双方未来签约，而有提案修法的急迫需要。

南亚科技计划在科学园区外的林口华亚园区，投资两千亿兴建两座十二吋晶圆制造厂，由于无法享受园区厂商的租税优惠，其中若以一千八百亿元购置机器设备，进口关税就约七十二亿元，还需每年负担约九亿一千万元的营业税及滞押利息，以及每年三亿元的原物料关税负担。

其他业者也反映，相同的半导体产业在园区内外有严重租税差异，将影响厂商的国际竞争力，也会降低国外厂商来台投资的意愿，政府必须尽速排除这些因租税不公带来的投资障碍。